Juodupės tvenkinys – tvenkinys Lietuvoje, Rokiškio rajone, Juodupės miestelio vakariniame pakraštyje. Sudarytas užtvenkus Vyžuonos upę (Nemunėlio intakas) 23,2 km nuo jos žiočių. Tvenkinio ilgis iš pietų į šiaurę – 1,2 km, plotis – iki 0,12 km. Altitudė 99,5 m. Vakarinis krantas aukštokas. Krantai daugiausia apaugę medžiais. Į vakarus plyti pievos, dirbami laukai ir dalis Stoniškio kaimo. Pietrytinėje pakrantėje yra paplūdimys. Tvenkinys įrengtas 1976 m.